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全國(guó)新冠核酸室間質(zhì)評(píng)報(bào)告發(fā)布!各大企業(yè)試劑產(chǎn)品各有優(yōu)缺.....

日期:2020-04-09


核酸檢測(cè)是新型冠狀病毒肺炎確診的重要手段。為了解我國(guó)新型冠狀病毒(2019?nCoV)核酸檢測(cè)的開展現(xiàn)狀及質(zhì)量狀況,國(guó)家衛(wèi)生健康委臨床檢驗(yàn)中心(以下簡(jiǎn)稱臨檢中心)于2020??3??16?~24?日開展了?2019?nCoV?核酸檢測(cè)室間質(zhì)量評(píng)價(jià),并將檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析。


本次臨檢中心下發(fā)了12個(gè)質(zhì)評(píng)樣本,均為國(guó)家衛(wèi)生健康委臨床檢驗(yàn)中心制備,為基因工程方法制備的噬菌體病毒樣顆粒模擬樣本,無(wú)生物傳染危險(xiǎn)性,其濃度采用數(shù)字PCR定量而來,樣本相關(guān)的信息如下:


全國(guó)返回855個(gè)實(shí)驗(yàn)室結(jié)果

本次共計(jì)?1296?家實(shí)驗(yàn)室報(bào)名,考慮到物流郵寄、自建方法信息的完整性等

因素,實(shí)際接受報(bào)名實(shí)驗(yàn)室數(shù)共計(jì)?889?,包括疾病預(yù)防控制中心、二級(jí)或三級(jí)公立醫(yī)療機(jī)構(gòu)(含綜合醫(yī)院、??漆t(yī)療機(jī)構(gòu)、婦幼保健機(jī)構(gòu))、獨(dú)立醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室、海關(guān)所屬國(guó)際旅行衛(wèi)生保健中心、試劑研發(fā)廠家、科研院所等,共覆蓋全國(guó)?31?個(gè)省份(含自治區(qū)、直轄市),。

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本次共計(jì)收到?855?家實(shí)驗(yàn)室的結(jié)果,其中有效結(jié)果的實(shí)驗(yàn)室數(shù)為?844?家(即回報(bào)結(jié)果完整、在截止日期內(nèi)回報(bào)的結(jié)果),采用單試劑檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)室?759?家,


采用兩種或兩種以上試劑檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)室?85?家,不同試劑檢測(cè)結(jié)果?931?份。

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評(píng)價(jià)原則和結(jié)果

新型冠狀病毒核酸檢測(cè)室間質(zhì)量評(píng)價(jià)的評(píng)價(jià)原則如下:

1假陰性結(jié)果:500?個(gè)copies/mL?以上濃度的?2019-nCoV?樣本均要求檢出,?包括202002202004202008??202011,未檢出為假陰性結(jié)果。

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2假陽(yáng)性結(jié)果:2019-nCoV?陰性樣本,包括其它冠狀病毒陽(yáng)性樣本,均應(yīng)報(bào)告?2019-nCoV?陰性。報(bào)告?2019-nCoV?陽(yáng)性為假陽(yáng)性結(jié)果。

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3PT?成績(jī)計(jì)算:?202010?號(hào)樣本不計(jì)分。

202001、202002、202004202005、202006、202007、202008202011、202012號(hào)樣本均要求與?2019-nCoV?預(yù)期結(jié)果相符,完全相符判定為實(shí)驗(yàn)室為合格;否則,為不合格。采用兩種試劑檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)室,以最終結(jié)果判定實(shí)驗(yàn)室成績(jī)是否合格(不單獨(dú)評(píng)價(jià)各試劑檢測(cè)結(jié)果)。

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4)質(zhì)評(píng)結(jié)果:本次質(zhì)評(píng)中,共計(jì)收到?844?家實(shí)驗(yàn)室的有效結(jié)果(即回報(bào)結(jié)果完整、在截止日期內(nèi)回報(bào)的結(jié)果),其中合格實(shí)驗(yàn)室?701 ?家(83.1%,不合格實(shí)驗(yàn)室?143

家(16.9%)。


結(jié)果統(tǒng)計(jì)

1?各樣本總體符合率和復(fù)檢率


(2)各實(shí)驗(yàn)室使用的方法學(xué)差異

使用方法包括包括實(shí)時(shí)熒光 RT-PCR、PCR-基因芯片、PCR-飛行時(shí)間質(zhì)譜、轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)的恒溫?cái)U(kuò)增、數(shù)字 PCR 和高通量測(cè)序方法(包括宏基因組測(cè)序)。但是實(shí)驗(yàn)室基本上都使用實(shí)時(shí)熒光 RT-PCR 方法,其它方法由于回報(bào)結(jié)果少,100%符合也不能說明該方法具有優(yōu)越性。

注:核酸檢測(cè)的假陽(yáng)性通常由于標(biāo)本間交叉污染和實(shí)驗(yàn)室擴(kuò)增產(chǎn)物遺留污染,但也可能是由特定試劑引物探針本身的特異性問題所致。


(3)各廠家產(chǎn)品差異

不同試劑對(duì) 202011、202008、202004 和 202002 號(hào)陽(yáng)性樣本的符合率和復(fù)檢率見表 6,202010 號(hào)樣本(128 copies/mL)共計(jì) 6 家實(shí)驗(yàn)室檢出,2 家為圣湘生物、2 家為達(dá)安基因、2 家為自建方法(實(shí)時(shí)熒光 PCR、數(shù)字 PCR 法各 1 家)。

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核酸檢測(cè)試劑:97.5%(908/931)的回報(bào)結(jié)果使用實(shí)時(shí)熒光 PCR 法,各試劑的分析敏感性存在差異。NMPA 批準(zhǔn)的試劑各陽(yáng)性樣本8×10?4?copies/mL?1.6×10?4copies/mL,?3.2×10?3?copies/mL,?640?copies/mL)檢測(cè)的符合率總體好于使用自建方法的實(shí)驗(yàn)室。


  • 陽(yáng)性樣本檢測(cè)結(jié)果的符合率和復(fù)檢率



  • 不同品牌的試劑各靶基因檢出率


各試劑不同靶區(qū)域的敏感性也存在差異。本次質(zhì)評(píng)樣本為?ORF?區(qū)和?N?區(qū)連接在一起的病毒樣顆粒,因此?ORF??N?區(qū)的數(shù)量是完全一致的,但是試劑對(duì)兩個(gè)區(qū)域檢測(cè)的陽(yáng)性率差異明顯。以回報(bào)結(jié)果數(shù)>10?份的試劑來看,總的來說,N?區(qū)的陽(yáng)性率高于?ORF?區(qū),樣本越弱,這一現(xiàn)象越顯著。


目前各試劑有單靶標(biāo)、雙靶標(biāo)和三靶標(biāo)檢測(cè)的方式在疫情初期臨床病例數(shù)不足,方法設(shè)計(jì)尚無(wú)法進(jìn)行充分的驗(yàn)證。但是在現(xiàn)階段,試劑廠家應(yīng)該已有一定數(shù)量的臨床數(shù)據(jù),用來論證一些方法設(shè)計(jì)的依據(jù)是否科學(xué)。


比如,要求兩個(gè)靶基因同時(shí)陽(yáng)性,那么單個(gè)靶基因陽(yáng)性的樣本,其中假陽(yáng)性的比例有多少?造成假陽(yáng)性的原因是什么?單靶標(biāo)陽(yáng)性必須要復(fù)檢一致,才能判定陽(yáng)性,那么如果不復(fù)檢,會(huì)造成假陽(yáng)性的比例有多少?造成假陽(yáng)性的原因是什么?雙靶標(biāo)或者三靶標(biāo)檢測(cè)的作用,主要是為了提高檢測(cè)的敏感性還是特異性?是否存在多引物探針之間的競(jìng)爭(zhēng)或者干擾?單靶標(biāo)陽(yáng)性的原因是什么?

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本次?全國(guó)新型冠狀病毒核酸檢測(cè)室間質(zhì)量評(píng)價(jià)?主要評(píng)價(jià)實(shí)驗(yàn)室對(duì)2019-nCoV?核酸檢測(cè)的能力,重點(diǎn)考察實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的分析性能,包括分析敏感性和分析特異性。

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室間質(zhì)評(píng)采用基因工程方法建立的噬菌體病毒樣顆粒模擬樣本(本實(shí)驗(yàn)室制備),無(wú)生物傳染危險(xiǎn)性。該樣本適用于?NMPA?批準(zhǔn)的新型冠狀病毒核酸檢測(cè)試劑,19?種未批準(zhǔn)的商品化試劑和?32?家不同實(shí)驗(yàn)室自建方法。

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本次質(zhì)評(píng),共計(jì)?844?家實(shí)驗(yàn)室回報(bào)有效結(jié)果,實(shí)驗(yàn)室總體檢測(cè)情況良好,合

格實(shí)驗(yàn)室?701?家(83.1%)。同時(shí)也反映出一些問題,具體如下。

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  • 假陰性結(jié)果

本次質(zhì)評(píng)含有?5?份陽(yáng)性樣本,分別為8×10?4??copies/mL,1.6×10?4??copies/mL,3.2?×10?3?copies/mL,?640?copies/mL?128?copies/mL。臨床研究表明,呼吸道和非呼吸道樣本中新型冠狀病毒載量平均為3.21×10?4??copies/mL2.21×10?2~4.71×10?5

copies/mL,呼吸道樣本中新型冠狀病毒載量平均4.33×10?4??copies/mL

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另一研究表明,痰液樣本濃度較高(中位數(shù)?7.52?× 10??copies/mL,咽拭子樣本濃度較低(中位數(shù)?7.99?× 10??copies/mL)。由于能獲取痰液的患者有限,臨床上鼻咽拭子采樣更為普遍。因此,本質(zhì)評(píng)樣本基本符合臨床樣本中病毒載量的情況。

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本次質(zhì)評(píng)要求實(shí)驗(yàn)室能夠檢出8×10?4?copies/mL,1.6×10?4?copies/mL,?3.2×10?3copies/mL, 640 copies/mL?四個(gè)濃度水平的樣本。各臨床實(shí)驗(yàn)室在?1.6×10?4?copies/mL?以上濃度水平,符合率均可以達(dá)到97%以上,主要的問題存在于對(duì)3.2×10?3?copies/mL??640 copies/mL?兩個(gè)弱陽(yáng)性樣本檢出能力。導(dǎo)致檢測(cè)假陰性的原因涉及核酸提取和檢測(cè)兩個(gè)過程。

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盡管實(shí)驗(yàn)室一般會(huì)很關(guān)注檢測(cè)試劑的性能,但實(shí)際上核酸提取試劑的質(zhì)量??也是檢測(cè)成功的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一。本次質(zhì)評(píng)中實(shí)驗(yàn)室使用的核酸提取方法包括手工-柱提取法、手工-磁珠提取法、自動(dòng)化儀器-柱提取法、自動(dòng)化儀器-磁珠提取法和一步法等,各實(shí)驗(yàn)室使用的核酸提取試劑種類超過 40 種,各檢測(cè)試劑均存在與多個(gè)核酸提取試劑搭配使用的情況。

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核酸檢測(cè)從提取到完成擴(kuò)增檢測(cè)是一個(gè)體系,但是如此多的核酸提取試劑,各種不同的操作程序,各實(shí)驗(yàn)室的檢測(cè)體系實(shí)際上并不相同。因此,即使采用同一核酸檢測(cè)試劑,但由于核酸提取試劑的不同,檢測(cè)的分析敏感性也必然會(huì)存在差異。

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相同核酸提取純化試劑,各實(shí)驗(yàn)室的檢測(cè)程序也有所不同。使用“中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司核酸檢測(cè)試劑”的 224 家實(shí)驗(yàn)室,58 家使用配套的“達(dá)安基因核酸提取純化試劑”,各實(shí)驗(yàn)室使用的核酸提取的樣本量均為 200μL ,但洗脫體積包括 40、50、60、80、90 和 100μL 等。

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實(shí)驗(yàn)室方面:各實(shí)驗(yàn)室人員提取的操作能力存在差異,個(gè)別實(shí)驗(yàn)室所有陽(yáng)性樣本均未檢出。造成這一結(jié)果的主要原因,很可能是人員操作的問題,當(dāng)然也不排除核酸提取試劑某一批次質(zhì)量存在問題的可能性。部分實(shí)驗(yàn)室盡管檢出陽(yáng)性樣本,但是從報(bào)告的 Ct 值來看,實(shí)際上也存在較大差異。


一些實(shí)驗(yàn)室在檢測(cè)過程中缺乏質(zhì)量控制及對(duì)單靶標(biāo)陽(yáng)性樣本解讀的能力不足,這部分實(shí)驗(yàn)室多開展臨床檢測(cè)時(shí)間不長(zhǎng),或者地區(qū)流行率低,日常檢出陽(yáng)性樣本數(shù)極少。甚至使用相同試劑的實(shí)驗(yàn)室對(duì)單靶標(biāo)的處理方式也不同。

  • 假陽(yáng)性結(jié)果

從質(zhì)評(píng)結(jié)果來看,假陽(yáng)性率較低,出現(xiàn) 2 例或 2 例以上假陽(yáng)性的實(shí)驗(yàn)室共 7 家(0.8%,7/844)。實(shí)驗(yàn)室污染(擴(kuò)增產(chǎn)物遺留污染和標(biāo)本間交叉污染)在少數(shù)實(shí)驗(yàn)室存在。部分試劑存在和其它冠狀病毒的交叉反應(yīng)。

綜上所述,我國(guó)目前臨床實(shí)驗(yàn)室對(duì) 2019-nCoV 核酸檢測(cè)能力較強(qiáng),同時(shí)也存在需要改進(jìn)的方面,建議各試劑廠家根據(jù)目前臨床應(yīng)用情況,總結(jié)臨床性能的數(shù)據(jù);自建方法應(yīng)加強(qiáng)對(duì)試劑性能的評(píng)價(jià);臨床實(shí)驗(yàn)室在開展檢測(cè)前或更換試劑批號(hào)時(shí),應(yīng)進(jìn)行性能驗(yàn)證,以發(fā)現(xiàn)不同試劑批號(hào)存在的差異以及驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)能力;臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)使用參與核酸提取過程的弱陽(yáng)性樣本和多份(如 3 份) 陰性樣本,進(jìn)行室內(nèi)質(zhì)量控制,以有效監(jiān)測(cè)實(shí)驗(yàn)室對(duì)弱陽(yáng)性樣本的檢測(cè)能力和實(shí)驗(yàn)室污染;臨床實(shí)驗(yàn)室人員應(yīng)加強(qiáng)實(shí)驗(yàn)操作和結(jié)果解讀能力的人員培訓(xùn)。

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參考資料:臨檢中心《全國(guó)新型冠狀病毒核酸檢測(cè)室間質(zhì)量評(píng)價(jià)結(jié)果報(bào)告》。

申明:本文內(nèi)參考自上述報(bào)告,僅供信息交流之用,請(qǐng)勿做他用,如涉及侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除。

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